Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTSS1O43312 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms