Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNJ2O15056 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms