Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPAN4O14817 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TSPAN4O14817 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms