Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DGG1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DGG1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms