Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC4A6NH21 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms