Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms