Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms