Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms