Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms