Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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