Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSFQ9UBX1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms