Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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