Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFIP11Q9UBB9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms