Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHPF2Q9P2E5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms