Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms