Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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