Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms