Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NECTIN3Q9NQS3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms