Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms