Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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