Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms