Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms