Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD1Q9BXT4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms