Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms