Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms