Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms