Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELF4Q99607 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms