Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBL7Q96S82 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms