Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms