Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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