Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG2BQ96BY7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms