Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms