Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC155Q8N6L0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms