Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms