Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms