Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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