Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALYREFQ86V81 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALYREFQ86V81 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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