Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRCQ7RTU9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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