Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GARNL3Q5VVW2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms