Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms