Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms