Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms