Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP41Q3LFD5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP41Q3LFD5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP41Q3LFD5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP41Q3LFD5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP41Q3LFD5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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