Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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