Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFKFB4Q16877 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFKFB4Q16877 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms