Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms