Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms