Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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