Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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