Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms